Plateforme Facture Électronique : Comment Choisir en 2026 ?
Pourquoi choisir une plateforme de facturation électronique ?
Il s'agit d'une obligation légale. Toutes les entreprises devront passer par une plateforme agréée pour envoyer et recevoir des factures. Si le calendrier varie selon la taille des entreprises, la loi s'appliquera sans exception.
L'économie française a besoin de se moderniser. Les classeurs pleins à craquer et les e-mails avec pièce-jointe vont laisser place à des flux de données rapides, fiables, et hébergés au sein de l'Union européenne.
Votre entreprise pourrait y gagner. En repensant vos flux de facturation, vous réduisez vos délais de paiement, fiabilisez votre pilotage et automatisez une partie de votre comptabilité.
5 plateformes agréées pour la facture électronique
Environ 100 plateformes agréées sont actuellement immatriculées par la DGFiP. Elles se distinguent par leur positionnement, leurs fonctionnalités et leurs tarifs. Voici cinq exemples représentatifs du marché :
Axonaut
Pour les PMEERP complet : facturation, CRM, gestion de stocks et suivi de projets dans une interface unifiée. Conçu pour les équipes de 5 à 50 collaborateurs.
Indy
Pour les indépendantsModèle tout-en-un : facturation, comptabilité automatisée et néobanque intégrée avec IBAN français.
Dougs
Pour la comptabilitéAccompagnement par expert-comptable dédié. Solution adaptée aux SASU, SAS et SARL recherchant optimisation fiscale et délégation comptable.
Digipharmacie
Pour les pharmaciesSolution sectorielle réglementée. Dédiée aux pharmacies d'officine, elle intègre la traçabilité des lots et la conformité sanitaire.
Jefacture.com (ECMA)
Pour les experts-comptablesS'adresse aux cabinets souhaitant déployer une solution chez leurs clients (modèle B2B2C). Gestion multi-dossiers et portail collaboratif.
Comment choisir votre plateforme agréée ?
Le choix d'une plateforme agréée ne se résume pas à comparer des prix. Six critères structurent une décision éclairée.
La taille de votre entreprise
1/6Un micro-entrepreneur n'a pas les mêmes besoins qu'une PME de 40 salariés. Les solutions tout-en-un (facturation + comptabilité + banque) conviennent parfaitement aux indépendants. Les structures plus importantes privilégieront un ERP offrant gestion multi-utilisateurs, droits d'accès différenciés et reporting consolidé. Vérifiez que la plateforme accompagne votre croissance sans changement d'outil à moyen terme.
Votre volume de factures
2/6Le volume mensuel de factures détermine le niveau d'automatisation nécessaire. Moins de 20 factures par mois ? Une solution simple suffit. Entre 20 et 100 factures, l'automatisation du rapprochement bancaire et des relances devient précieuse. Au-delà de 100 factures mensuelles, privilégiez les plateformes offrant import en masse, API et workflows personnalisés.
Vos besoins fonctionnels
3/6Identifiez vos priorités parmi ces périmètres : facturation pure (devis, factures, avoirs), comptabilité intégrée (synchronisation bancaire, déclarations), gestion commerciale (CRM, pipeline), stocks et achats, ou accompagnement expert-comptable. Si votre activité ou votre secteur nécessite des logiciels spécifiques, vous aurez le choix entre utiliser un logiciel tout-en-un, et vous construire un éco-système de logiciels qui communiquent entre eux.
Votre budget
4/6Les tarifs varient considérablement selon le positionnement. Estimez un budget réaliste en fonction de votre taille : micro-entreprise (0-15 €/mois), TPE établie (20-50 €/mois), PME (50-150 €/mois), ETI/GE (sur devis). Attention aux modèles freemium attractifs qui peuvent devenir coûteux avec la croissance.
Votre stack logicielle existante
5/6Listez vos outils actifs : logiciel comptable, CRM, e-commerce, ERP. La plateforme choisie doit s'intégrer sans friction. Vérifiez la disponibilité des connecteurs natifs ou d'une API ouverte. Un changement complet de stack peut s'avérer plus simple qu'une intégration bancale entre outils incompatibles. Contactez vos fournisseurs de logiciels actifs pour savoir comment ils s'adaptent à la réforme de la facture électronique.
Votre secteur d'activité
6/6Certains secteurs imposent des contraintes spécifiques. Le BTP requiert la gestion des situations de travaux et retenues de garantie. La santé exige traçabilité et conformité réglementaire. La restauration nécessite l'intégration caisse. Si votre métier présente des particularités, considérez une solution sectorielle.
Quel est le tarif d'une plateforme agréée ?
Les tarifs varient de 0 € (offres gratuites limitées) à plus de 150 €/mois pour les solutions complètes. Comptez 0-15 € pour un indépendant, 20-50 € pour une TPE, 50-150 € pour une PME.
Les tarifs des plateformes agréées sont principalement déterminés par les fonctionnalités qu'elles intègrent :
Gratuit
5-15 €/mois
20-50 €/mois
50-150 €/mois
Sur devis
| Fourchette | Type de logiciel | Exemples |
|---|---|---|
| Gratuit | Facturation | Indy |
| 5-15 €/mois | Comptabilité | Abby |
| 20-50 €/mois | Automatisation | Dougs |
| 50-150 €/mois | Logiciel de gestion | Axonaut |
| Sur devis | ERP | Agicap |
Plusieurs facteurs font varier le prix final :
- Fonctionnalités : facturation, comptabilité, CRM, banque, administratif… chaque bloc de services ajouté peut faire grimper le prix de l'abonnement.
- Durée d'engagement : un abonnement triennal peut réduire le tarif de 30 à 50 %.
- Volume de factures : certaines plateformes facturent au-delà d'un seuil mensuel.
- Nombre d'utilisateurs : surcoût de 5 à 15 €/utilisateur supplémentaire.
- Niveau d'accompagnement : l'accès à un expert-comptable dédié augmente significativement la facture.
Coûts cachés à anticiper
- Frais bancaires si néobanque intégrée
- Commissions sur paiement en ligne (1,5 à 3 %)
- Modules optionnels (signature électronique, API premium)
- Coûts de migration des données existantes
- Formation des équipes
Quelle plateforme choisir selon votre profil ?
Le choix de votre plateforme agréée dépend avant tout de vos besoins métiers. Voici les scénarios les plus courants.
Facturation & Documents
Vous êtes auto-entrepreneur et avez simplement besoin d'envoyer des devis et factures conformes. Une plateforme d'entrée de gamme, voire gratuite, couvrira l'essentiel de vos besoins.
Comptabilité & Déclarations
Vous dirigez une petite agence redevable de la TVA et souhaitez déléguer vos déclarations URSSAF et TVA. Optez pour une plateforme intégrant l'automatisation comptable et la télétransmission.
Banque & Trésorerie
Vous êtes une TPE et préférez centraliser facturation et compte bancaire. Une plateforme avec néobanque intégrée synchronise vos dépenses en temps réel et vous évite de cumuler les abonnements.
CRM & Gestion commerciale
Vous gérez une petite PME et cherchez à structurer votre relation client. Une plateforme avec CRM intégré vous aide à suivre vos prospects, relancer vos devis et fidéliser votre portefeuille.
Accompagnement & Support
Vous dirigez une PME familiale et avez besoin d'être accompagnés dans la prise en main. Privilégiez une plateforme proposant formation, support réactif et interlocuteur dédié.
Juridique & Administratif
Vous êtes auto-entrepreneur et passez en SASU. Certaines plateformes proposent un service juridique intégré qui simplifie vos formalités de création ou de transformation.
Automatisation & Intégrations
Vous êtes une ETI avec un écosystème logiciel existant (ERP, CRM, BI). Assurez-vous que la plateforme dispose d'API ouvertes et de connecteurs natifs pour s'intégrer à votre stack.
Les erreurs à éviter lorsque vous choisissez votre plateforme (PA, PDP)
Erreurs fréquentes
- Choisir uniquement sur le prix sans vérifier l'adéquation avec vos besoins réels
- Opter pour une plateforme qui couvre des besoins déjà couverts par vos logiciels actuels
- Confondre facture en ligne (format PDF) et facture électronique (format Factur-X)
- Négliger les coûts cachés : utilisateurs supplémentaires, modules optionnels, frais divers, expertise comptable…
- S'engager sur trois ans sans avoir testé la solution en conditions réelles
- Sous-estimer le temps de migration et de formation de vos équipes
- Attendre septembre 2026 pour vous décider et s'exposer à des amendes
Quand sera obligatoire la facture électronique ?
Deux échéances clés : 1er septembre 2026 (réception obligatoire pour tous, émission pour GE et ETI) et 1er septembre 2027 (émission obligatoire pour PME et micro-entreprises).