Meilleur logiciel Facturation Agréé pour TPE et PME

Comparatif des meilleurs logiciels de facturation électronique pour TPE et PME. Solutions agréées PA/PDP, simples et conformes 2026.
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Gestion d'entreprise PME

Points forts

  • Solution tout-en-un incluant CRM, paiements et trésorerie
  • Tarif abordable avec certification PA incluse dans l'abonnement
  • Interface intuitive 100% française conçue pour TPE/PME
  • Portail expert-comptable gratuit avec synchronisation automatique

Inconvénients

  • Comptabilité simplifiée, moins adapté aux besoins comptables complexes
  • Pas d'offre spécifique pour associations ou structures particulières
  • Facturation en mois pleins uniquement (pas de prorata)
Prix
À partir de 39€/mois
tout inclus
Utilisateurs
320 000 utilisateurs
Coût supplémentaires
Services externes payants
Fonctionnalités
Licence par utilisateur
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Néobanque comptabilité TPE

Points forts

  • Plateforme agréée 100% gratuite pour la vie, sans aucun frais caché pour l'émission et réception de factures
  • Solution tout-en-un intégrant facturation, comptabilité, compte pro et e-reporting dans une seule interface
  • Note exceptionnelle de 4,8/5 sur 4 700 avis avec plus de 300 000 entrepreneurs utilisateurs
  • Interface intuitive avec accompagnement pas à pas, idéale pour les indépendants et TPE sans expertise technique

Inconvénients

  • Positionnement spécifique TPE/PME pouvant limiter les fonctionnalités avancées pour grandes entreprises
  • Ecosystème relativement jeune comparé aux acteurs historiques avec moins de cas d'usage complexes
  • Dépendance forte à l'écosystème Tiime pouvant compliquer une migration future vers un autre outil
Prix
Gratuit
tout inclus
Utilisateurs
Plus de 300 000 entrepreneurs
Coût supplémentaires
Services externes payants
Fonctionnalités
Licence par utilisateur
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Néobanque pro TPE

Points forts

  • Plateforme Agréée certifiée DGFiP (PA n°23) avec conformité 2026 garantie sans surcoût additionnel
  • Solution tout-en-un combinant compte pro, facturation électronique Factur-X, suivi trésorerie et 80+ intégrations tierces
  • Virements instantanés en moins de 10 secondes et prélèvements SEPA pour encaissements rapides
  • Interface moderne et intuitive avec application mobile complète pour gestion nomade

Inconvénients

  • Nécessite un compte bancaire Qonto pour accéder aux fonctionnalités avancées (intégrations, paiements instantanés)
  • Pas de dépôts d'espèces ni d'émission de chèques physiques
  • Tarifs mensualité supérieurs aux solutions de facturation pure (à partir de 9€/mois pour compte Basic)
Prix
Gratuit (facturation incluse)
tout inclus
Utilisateurs
500 000+ utilisateurs
Coût supplémentaires
Services externes payants
Fonctionnalités
Licence par utilisateur
Immatriculée
CRM, facturation et trésorerie tout-en-un

Points forts

  • Plateforme Agréée certifiée pour 2026 avec formats structurés inclus sans surcoût
  • Solution tout-en-un CRM, facturation, trésorerie dans interface intuitive
  • 23 000 entreprises clientes, rachat TeamSystem en septembre 2025
  • Relances automatiques et paiement en ligne intégré

Inconvénients

  • Tarif débute à 39€ HT par utilisateur mensuel
  • Richesse fonctionnelle demande temps d'adaptation initial
  • Configurations avancées nécessitent accompagnement technique
Prix
À partir de 39€/mois
tout inclus
Utilisateurs
23 000 entreprises clientes
Coût supplémentaires
Services externes payants
Fonctionnalités
Licence par utilisateur
Immatriculée
Compta experts-comptables

Points forts

  • Interface intuitive et moderne ne nécessitant aucune compétence comptable préalable pour une prise en main rapide
  • Facturation électronique 2026 incluse gratuitement dans tous les plans avec immatriculation PA officielle validée
  • Synchronisation bancaire automatique avec plus de 100 banques françaises et catégorisation intelligente par IA
  • Collaboration temps réel avec expert-comptable intégrée dans la plateforme éliminant les échanges d'emails

Inconvénients

  • Tarifs plus élevés que certaines alternatives démarrant à 14€/mois contre 7-10€ chez concurrents
  • Gestion multi-devises encore limitée nécessitant des améliorations selon utilisateurs
  • Configuration initiale peut prendre du temps pour paramétrer catégories et connexions bancaires
  • Certaines fonctionnalités avancées réservées aux plans Essentiel 24€/mois et Premium sur devis
Prix
À partir de 14€/mois
tout inclus
Utilisateurs
350 000 entreprises
Coût supplémentaires
Services externes payants
Fonctionnalités
Licence par utilisateur

Tableau Comparatif des Fonctionnalités

Plateforme
Conformite 2026
Interface Intuitive
App Mobile
Relance Automatique
Support Francais
Offre Gratuite
Axonaut
TIIME PDP
QONTO
Sellsy
PENNYLANE

F.A.Q

Questions fréquentes

Les TPE sont-elles concernées par la facturation électronique ?
Qui est concerné par la dématérialisation des factures ?
Quand la facturation électronique est-elle obligatoire ?